交叉学科大数据研究中心

张军

张军,博士,深圳大学特聘副研究员、助理教授

Email:junzhang@szu.edu.cn

2022年博士毕业于哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业,2023年加入深圳大学大数据系统计算技术国家工程实验室。深圳市鹏城孔雀C类人才,中国计算机学会(CCF)生物信息学专委委员、自然语言处理专委委员。主要研究领域包括生物信息学、机器学习、自然语言处理、计算机辅助药物设计,致力于借助机器学习和自然语言处理等领域的理论和技术解决生物信息学中面临的难题,如蛋白质与核酸之间的相互作用识别与优化问题、核酸适配体合成问题等。近五年在Trends in Genetics、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics等重要期刊发表学术论文20余篇,1篇入选ESI高被引论文,参与出版著作1项。主持国家自然科学基金青年项目、广东省自然科学基金面上项目、深圳市高精尖紧缺人才启动项目、大数据国家工程实验室内部重点项目。曾获研究生国家奖学金、哈尔滨工业大学优秀硕士毕业生等多项荣誉。兼任Briefings in Bioinformatics、Trends in Analytical Chemistry、Communication Biology在内的多个国际期刊及会议的审稿人。

当前研究课题:

-生物信息学:生物语言大模型、蛋白质与核酸相互作用识别与优化、蛋白质及多肽设计

-机器学习:无监督表示学习、强化学习、图神经网络

Openings:招聘博后、科研助理;招收2025级硕士研究生2名,联合培养博士研究生1名,欢迎对上述方向感兴趣的同学、硕/博士毕业生与我联系!

具体要求:勤奋踏实,有较好的编程、数学、英语基础,以及较为独立的思考能力。

部分研究成果:

1. Junhang Cao#, Jun Zhang#, Qiyuan Yu, Junkai Ji, Jianqiang Li, Shan He, Zexuan Zhu. TG-CDDPM: text-guided antimicrobial peptides generation based on conditional denoising diffusion probabilistic model[J]. Briefings in Bioinformatics. 2025, 26(1):bbae644 . (中科院一区, CCF B类)

2. Jun Zhang, Mei Lang, Yaoqi Zhou, Yang Zhang. Predicting RNA structures and functions by artificial intelligence[J].Trends in Genetics. 2024., 40(1): 94-107. (中科院一区)

3. Jun Zhang, Ke Yan, Qingcai Chen, Bin Liu. PreRBP-TL: prediction of species-specific RNA-binding proteins based on transfer learning[J].Bioinformatics. 2022, 38(8): 2135–2143.(CCF B类)

4. Jun Zhang, Qingcai Chen, Bin Liu. NCBRPred: predicting nucleic acid binding residues in proteins based on multilabel learning[J].Briefings in Bioinformatics. 2021, 22(5): bbaa397. (中科院一区, CCF B类)

5. Jun Zhang, Qingcai Chen, Bin Liu. iDRBP_MMC: Identifying DNA-Binding Proteins and RNA-Binding Proteins Based on Multi-Label Learning Model and Motif-Based Convolutional Neural Network[J].Journal of Molecular Biology. 2020, 432(22): 5860-5875. (中科院二区)

个人主页:https://www.researchgate.net/profile/Jun-Zhang-222